對于整個的庫房，要進行分區，劃分出辦公區和耗材存放區。辦公區和存放區要嚴格分開，辦公區用于打印入庫出庫票據，存放單據和材料檢驗報告資質等文件資料。存放區要安裝排氣扇和空調，耗材時刻在釋放有毒氣體，要隨時保持空氣暢通及適宜的溫度濕度。耗材存放區還要分成待檢區、合格區、不合格區（退貨區）。待檢區用于放剛收的貨物，待庫管和采購驗收合格，入庫后進入合格區存放；若存在包裝破損，效期近等質量問題即進入不合格區，由采購及時聯系供應商退貨。合格區按大類進行分區存放，如輸液器，注射器，手套（薄膜手套、乳膠手套、滅菌手套），棉簽，手術墊單，采血管，麻醉呼吸（麻醉包、鎮痛泵、螺紋管等），婦科專用（避孕套、產包、擴陰器），骨科專用（石膏、固定帶、拐杖），消毒品區等；這些要求存量大，各個科室使用也快，劃分的區域要大，以保障臨床科室使用需求。還有些使用量小，但必不可缺，如針線，手術刀片，尿管，T管等型號要求要全，量小，可以使用展示架存放便于及時找到貨物。
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